Quando gerar uma entrada compra e o financeiro não foi gerado no contas a pagar significa que o tipo de documento utilizado na entrada compra não está configurado para gerar financeiro.
- Acesse o menu Entradas;
- Clique na opção Compra;
- Selecione a compra que deseja alterar;
- Clique no botão Alterar:

- No campo Status, marque como aberto, para abrir a venda e conseguir editá-la:

- Após abri-lá edite a compra, clicando no botão editar:

- Edite o Tipo de documento:

- Verifique se o campo Gera financeiro está marcado como Sim.

Você pode estar marcando o campo Gera financeiro como sim ou então escolher outro tipo de documento que gere financeiro.
- Clique no botão Finalizar entrada:

- Selecione o botão Salvar e gerar financeiro:

- Clique em Validar e finalizar:

Após isso seu boleto constará no contas a pagar de sua empresa.